Trung tâm Chăm sóc, Nuôi dưỡng và Điều trị nạn nhân bị nhiễm chất độc da cam/dioxin Hà Nội tiền thân là Trung tâm Phòng chống tệ nạn xã hội tỉnh Hà Tây được thành lập theo Quyết định số 414/QĐ-UB, ngày 28/9/1994 của Ủy ban nhân dân tỉnh Hà Tây.
Ngày 29/4/2002, Ủy ban nhân dân tỉnh Hà Tây ban hành Quyết định số 535/2002/QĐ-UB về việc đổi tên và kiện toàn tổ chức bộ máy của Trung tâm phòng chống tệ nạn xã hội thành Trung tâm Giáo dục Lao động xã hội thuộc Sở Lao động – Thương binh và xã hội. Tổ chức bộ máy của Trung tâm gồm Ban Giám đốc và 03 phòng nghiệp vụ (Phòng Tổ chức Hành chính – Kế toán; Phòng Quản lý Giáo dục; Phòng Y tế phục hồi sức khỏe).
Ngày 29/5/2008, Quốc hội thông qua nghị quyết điều chỉnh địa giới hành chính thành phố Hà Nội: Hợp nhất toàn bộ tỉnh Hà Tây vào thành phố Hà Nội. Ngày 03/10/2008, Ủy ban nhân dân thành phố Hà Nội ban hành Quyết định số 1062/QĐ-UBND về việc đổi tên và xác định lại vị trí của Trung tâm Giáo dục Lao động xã hội trực thuộc Sở Lao động – Thương binh và xã hội Hà Tây (cũ) thành Trung tâm Giáo dục – Lao động xã hội số VIII Hà Nội trực thuộc Sở Lao động – Thương binh và xã hội Hà Nội.
Ngày 14/12/2015, Ủy ban nhân dân thành phố Hà Nội ban hành Quyết định số 6883/QĐ-UBND về việc đổi tên, xác định lại chức năng, nhiệm vụ và kiện toàn cơ cấu tổ chức bộ máy của Trung tâm Giáo dục – Lao động xã hội số VIII Hà Nội thành Trung tâm Chăm sóc, Nuôi dưỡng và Điều trị nạn nhân bị nhiễm chất độc da cam/dioxin thành phố Hà Nội trực thuộc Sở Lao động – Thương binh và xã hội Hà Nội.
Ngày 07/3/2025, Ủy ban nhân dân thành phố Hà Nội ban hành Quyết định số 1316/QĐ-UBND về việc chuyển đổi cơ quan chủ quản của các đơn vị sự nghiệp công lập. Hiện tại, Trung tâm Chăm sóc, Nuôi dưỡng và Điều trị nạn nhân bị nhiễm chất độc da cam/dioxin Hà Nội trực thuộc Sở Nội vụ thành phố Hà Nội quản lý.